首先可以肯定的是患上巧克力囊肿后具有很大的几率复发，虽然这是一种良性疾病，但是大多数患者在做完手术后都会出现复发的情况。手术两年后复发几率是20%，五年后复发几率是50%左右，病情复发后治疗起来会更加困难。

患上巧克力囊肿后需要根据囊肿的大小选择合适的治疗方法，如果囊肿小于5公分，那么可以采取保守治疗；如果囊肿大于5公分，则需要进行手术治疗。很多患者治疗后都会担心出现复发的情况，如果复发则会对身心带来很多伤害。那么，巧克力囊肿会复发吗？
　　一、巧克力囊肿会复发吗
　　巧克力囊肿是很容易复发的一种良性疾病，一般情况下，患上该疾病后做完剔除术两年后复发率是20%，5年后复发率是40~50%，出现复发情况后需要再次进行手术，而且治疗起来也会比较困难。患上该疾病后，医生会根据个人情况和病因制定合理的治疗方式，对于比较年轻的患者，在治疗的同时还应该保护卵巢功能，通过调整饮食和生活习惯，减少复发的几率。
　　二、巧克力囊肿复发的原因
　　1、内分泌因素
　　会患上巧克力囊肿和女性的内分泌因素具有很大的关系，大多数患有该疾病的患者都是在内分泌旺盛的年纪。所以在日常生活中需要养成良好的生活习惯，这样可以避免内分泌失调，从而出现复发的情况。
　　2、性生活频繁
　　如果女性在平时性生活比较频繁，则可能会导致巧克力囊肿复发，尤其是在经期性生活，子宫收缩会导致子宫内膜随着经血进入卵巢和腹腔，从而导致该疾病复发。
　　3、治疗不彻底
　　患上该疾病后通常需要进行手术治疗，但是一些患者在手术过后切除的不够彻底，导致体内还有残留的子宫内膜。随着时间的推移，子宫内膜会继续生长，还会覆盖卵巢组织，从而导致巧克力囊肿再次复发。
　　4、子宫病变
　　该疾病主要是因为月经期内成就的子宫壁脱落碎片进入卵巢生长所引起的，所以该疾病和经血引流不畅，无法在经期正常全部从阴道排出具有直接关系。如果子宫出现了病变，也可能会导致病情复发，其中包括阴道闭锁、子宫后倾、子宫颈口粘连等等。