肠镜检查主要是指电子结肠镜检查，它主要是检查大肠，肠镜检查对人体是没有伤害的，肠镜检查一般是不会对肠道造成什么影响的，但是任何有创的检查、操作都有相应的风险。

肠镜检查本身安全性还是比较大的，肠道穿孔等可能性在经验丰富的医生操作下不会出现。肠镜检查从肛门进入，通过肠道，对一些疾病进行确诊。肠镜是用来检查人体肠道的一个仪器，可以有效的查明人体肠道部位是否存在有问题，但也有许多人对于其是否有害存在有疑问。那么，究竟做肠镜会伤肠道吗？
　　这个和操作人的水平有关，因为肠镜检查是通过钩拉来套住肠子，（肠镜的长度才有1.5米），在钩拉的过程中肠镜有可能会刮到肠壁的粘膜，就好像平时的皮肤被指甲部小心刮过后会出现一道红色的充血一样，这个属于正常现象。
　　一般有一定的危险性的，大肠镜检查是利用一条长约140CM可弯曲，末端装有一个光源带微型电子摄影机的纤维软管，由肛门慢慢进入大肠，以检查大肠部位之病变，肿瘤或溃病，如有需要可取组织检验或行大肠息肉切除。
　　声明一点，任何有创的检查、操作都有相应的风险。肠镜检查、活检等本身安全性还是比较大的，肠道穿孔等可能性在经验丰富的医生面那里还是很少见的，但是做肠镜时可能导致其他疾病风险，还是需要警惕的。比如肠镜时的心脏风险、麻醉误吸风险等等，就是需要加以注意的。做肠镜时的心脏病、心肌梗塞等发作，其风险远远高于肠镜。
　　在医疗方面，选择任何的检查手段，都会考虑利弊，如果弊大于利，一定不会考虑，而且也会被历史淘汰。肠镜对患者的身体，肯定是会导致一定的伤害的，因为镜身的进出，可能导致粘膜损伤，相对来说影响轻微，由于肠道强大的再生愈合能力，几天就可以修复。其次就是活检，活检可能导致肠道的穿孔，不过经验丰富的医生一般比较少出现这样的并发症。
　　肠镜检查是目前发现肠道肿瘤及癌前病变最简便、最安全、最有效的方法。但毕竟，内镜检查是一种有创性的检查方法，有一定的不适和并发症。无痛肠镜的出现很好的解决了这些问题，它的本质是在检查前通过静脉注射一种快速、有效时间短、麻醉准确的麻醉剂，使患者在几秒钟内入睡，在完成所有检查后早起，检查过程中不会出现不适和疼痛，所以越喜欢它。然而，肠镜检查也存在一些缺点，如麻醉意外，有时麻醉恢复过程较长，且成本较高。