咬合的时候耳朵旁边的骨头疼可能是颞下颌关节紊乱综合征、茎突综合征、化脓性中耳炎等疾病导致，患者可以采取药物治疗、手术治疗等方式进行处理。

1、颞下颌关节紊乱综合征：颞下颌关节紊乱综合征的病因尚未明确，考虑是关节内外创伤、抑郁等多种因素导致，患者主要症状为张闭口咀嚼肌疼痛、耳鸣、眩晕等。可以遵医嘱口服阿司匹林片、布洛芬缓释胶囊等非甾体抗炎药物进行止痛治疗，也可以通过关节清理术、关节镜手术等方式进行治疗。

2、茎突综合征：茎突综合征通常由茎突本身的长度、方位等异常引起，患者可能会出现咽部疼痛、颈部疼痛、耳鸣等不适症状，也可能会导致咬合时耳朵旁边的骨头疼。患者可以根据实际情况通过颈外径路手术切短茎突，进而改善不适症状。

3、化脓性中耳炎：化脓性中耳炎主要是细菌感染导致的，患者可能会出现耳痛、耳溢液等症状，咬合时可能会进行局部牵拉，进而出现疼痛的情况。患者可以遵医嘱口服阿莫西林胶囊、头孢克洛片等抗炎药物进行治疗。

如果患者出现上述不良病症，应该及时前往医院就诊，通过超声、耳道镜等方式了解病症情况，然后对症治疗。同时患者应该注意休息，避免剧烈运动，而且应该避免辣椒、洋葱等刺激性食物，以免加重不适症状，不利于病症控制。