胃癌癌前病变的分子生物学领域的研究发现，胃癌基因的过度表达或突变，与癌前病变发生癌变有确切的关系。已经发现的几种与癌变有关的原癌基因有ras、c-met、c-myc、del-2、p53、c-erb和p16。

肠化细胞来自固有腺体颈部增殖细胞。IM分为完全型和不完全型两种，完全型小肠化生的上皮分化好，是一种常见的黏膜病变，属于炎症反应性质;而不完全型结肠化生上皮分化差，在肠型胃癌旁黏膜中检出率很高<88.2%)，说明不完全型化生与肠型胃癌的发生有密切关系。Morson观察到107例胃癌中有32.7%来源于肠化生灶，Sugario在早期胃癌内找到Panetn 细胞及杯状细胞，Tarri等学者观察到在许多肠化区域发生胃癌。肠化生细胞可能吸收某些脂质，由于缺乏乳糜管而使昅收的脂质不能立即转入循环，而滞留于肠化上皮细胞内成为致癌物质.在CAG患者的胃液中pH及亚硝酸盐含量明显高于正常胃液，其原因可能由于胃腺体萎缩、胃酸分泌减少.胃内硝酸盐还原率增多，使硝酸盐还原为亚硝酸盐，从而使亚硝胺类化合物在胃内合成增多而致癌。