怀孕90天戒烟是否来得及，需要根据具体情况进行判断。若胎儿各方面检查均正常，及时戒烟还来得及；但若出现畸形或其他异常情况，则来不及，应尽早终止妊娠。

理论上来说，备孕前三个月就应彻底戒烟，怀孕期间更不能吸烟。因为烟草中含有多种有毒有害的物质，比如尼古丁、焦油以及一氧化碳等，这些物质不仅会影响孕妇自身的健康，对胎儿的危害也比较大，容易导致胎儿畸形，也会加大流产和早产的几率。如果怀孕已经90天，意味着怀孕时间超过三个月，需要到医院进行必要的检查，若各项检查结果正常，然而并没有出现畸形或其他问题，怀孕90天戒烟是来得及的。及时戒烟可以减少尼古丁、焦油等有害物质对身体造成损伤，防止胎儿在后期发育过程中出现异常。

但部分人有长时间的吸烟史，在怀孕后90天内吸烟量也比较大，对胎儿造成的影响也比较大。如果此时检查发现胎儿出现畸形或者其他异常问题，戒烟已经来不及，需要考虑进行人工流产手术，及时终止妊娠。