阿米巴肝脓肿常表现为长期发热伴有右上腹痛及肝肿大和压痛，全身消耗等症状。阿米巴性肝脓肿可继续扩大并向周围组织穿破形成膈下脓肿、脓胸、肺脓肿或造成肝-支气管瘘或胸膜-支气管瘘，还可破入心包，穿入腹腔，引起相应部位的阿米巴性炎症。少数情况下也可引起阿米巴性脑脓肿、皮肤阿米巴病、阿米巴性角膜炎、生殖器阿米巴病等。