任何药物长期服用都会产生一些不良反应，而甲硝唑作为抗生素药物，常会有恶心呕吐，或者是腹部疼痛，但是这些不良反应一般都是不影响治疗的。有一些少数的患者服用了甲硝唑后，可能会出现荨麻疹的情况，或者是皮肤瘙痒，泛红等，都是患者不用太过担心，停药之后就会恢复了。要引起注意的是在服用甲硝唑之后，会使尿液变成深红色，患者不必太过担心，这是正常的情况。甲硝唑会抑制酒精代谢，所以在用药期间应该要戒酒，饮酒后可能出现腹痛，呕吐或头痛等症状。