舌下腺囊肿的首选是手术治疗，即将囊肿及相关腺体一并切除，基本能达到疗效，有效防止复发。如果病人不愿意选择手术治疗，也可以尝试保守治疗，鞘内注射碘酊破坏囊肿上皮细胞，防止粘液分泌，从而达到治疗效果。舌下腺囊肿不经治疗是不会自行治好的。有时会破囊肿，粘液流出，囊肿可以有一定的缩小，但通常过一段时间就会逐渐复发。