肝门部胆管癌病人的存活时间取决于疾病发现的时间。发现早期病人的治疗效果较好，但大多数病人难以发现，因为早期无症状，黄疸往往发生在后期。此外，由于肝门部胆管癌的特殊部位和手术切除率低，大多数病人的治疗效果较差。手术切除病人的5年生存率约为20%左右，未切除病人的生存率更低。