造成精子DNA完整性差的原因很多，可能最常见的原因包括精索静脉曲张，一种导致睾丸血液循环不良的疾病，导致代谢物的积累，或者一些局部温度的升高，这些因素导致精子DNA的分解，在其情况下，导致生殖系统的感染。如果明确地在睾丸或附睾感染，这可能会损害精子DNA，如果服用一些药物，这些药物可能会影响精子DNA完整性，也会对精子的产生产生一些不良影响。