早孕期是怀孕的前3个月，如果孕妇有流感，病毒会严重影响肚子里的胎儿，对胎儿的致畸概率很高，具体概率不好说，如果及时发现，及时坚持治疗，应该没有影响。如果不放心，可以再怀孕，孕期十六周左右做一次唐氏筛查，只要结果为低风险的话，就说明没有影响的，可以继续妊娠。平时一定要注意饮食健康，适当锻炼增强抵抗力。