首先，自身免疫性肝炎的遗传易性，这与人类淋巴细胞抗原II类相关等位基因有关。第二、分子模拟假说，多种外源物质。如病毒药物，其表位与自身抗原相同或相似，从而突破自身抗原耐受，自身反应性t细胞和抗原提呈细胞，是自身免疫性肝炎发病的又一必要条件。第三、补体系统和趋化因子也参与了自身免疫性肝炎体液损伤的机制。在自身免疫性肝炎的发病机制中，主要的自身抗原是去唾液酸糖蛋白受体。