女性尿道与阴道、肛门邻近，很多大肠细菌也会闯入尿道，引发尿路感染，导致尿痛。虽然女性尿路的表面上覆盖着一层像似保护膜的粘液层，在正常情况下，阴道粘膜会滋生一种乳酸杆菌，使阴道呈酸性，可以抑制细菌侵入。但这些自然防御功能因先天性缺乏或后天性改变时，容易引发阴道或尿路感染。这些改变包括：肿瘤或结石阻碍尿液排泄。膀胱膨出使尿路结构与功能改变。使用避孕杀精剂、滥用抗生素导致阴道常在菌的改变。更年期妇女缺乏荷尔蒙。尿路器械手术或插尿管等破坏尿路粘液保护层。对肥皂、卫生纸、润滑剂、阴道清洗剂、避孕海绵或泡沫过敏时，也会引起尿道口痛。