习惯性流产的检查方法主要是针对所有病因的筛查。解剖因素导致的流产，需要进行彩超加三维彩超的检查，遗传因素导致的流产，需要进行夫妻双方和胚胎组织物的染色体检查，内分泌因素导致的流产，需要检查甲状腺功能、血糖、血脂等，免疫因素导致的流产，需要采血化验，比如说抗磷脂综合征抗体、双链DNA以及抗核抗体提取物。还有一些封闭抗体等的检查，男方因素导致的流产，需要检查精子碎片DNA，同型半胱氨酸水平，精子质量以及染色体等。