肠镜相对胃镜来说，痛苦比较小。做肠镜检查的时候，由于检查的需要，会少量的注入气体，会有腹胀的感觉，这时候肛门放松，排出气体，就可以了。另外，由于肠腔弯曲，在镜子拐弯的时候，会碰到肠壁，或者进镜较深，这时候会感觉到短暂的腹痛。总的来说不算很痛苦，是可以忍受的。