海洛因肾脏病的发病机制尚不明确，可能是多种肾损害的综合结果。海洛因静脉药物依赖者常常表现出一系列免疫病理反应，例如γ免疫球蛋白升高、梅毒血清试验假阳性、抗自身平滑肌抗体阳性等，提示可能有免疫机制参与海洛因肾脏病的发生。此外，对海洛因肾脏病肾组织活检标本进行免疫荧光检查显示有免疫球蛋白和补体沉积，同样提示免疫机制可能是导致海洛因肾脏病的原因。