出现慢性腹泻后可以吃磺胺类药物，该类药物有很好的止泻疗效，不过服药时最好遵听医嘱。如果腹泻情况比较严重，则可以应用吸附性止泻药。另外，因细菌、真菌引起的慢性腹泻，可服用抗生素来抑菌杀菌，达到治疗目的。而中药上可以服用人参健脾丸、六君子丸、附子理中丸等中成药来治疗慢性腹泻。

慢性腹泻的推拿治疗方法之一就是揉外劳，也就是说按揉手背中央的外劳宫穴，再就是补脾土，也就是在脾土穴做顺时针推拿。运内八卦也是慢性腹泻常见的推拿治疗方法。除此以外，摩腹、揉脐以及按揉足三里等推拿方法也都有助于治疗慢性腹泻。

如果患上了慢性腹泻，可以根据病情选择合适的药物来治疗，比较常用的药物就是止泻药、肠道微生态制剂以及生长抑素及其类似物。慢性腹泻还需要根据病因进行相应的治疗，比如乳糖不耐受要避免食用乳制品，除此以外，对症支持治疗也是很重要的。

慢性腹泻患者可以进行实验室检查、影像学检查、黏膜活组织检查、大便常规检查、纤维肠镜检查、胃镜和小肠镜检查等等。通过这些检查方法，能够有效的判断慢性腹泻的严重程度以及病变部位，然后结合检查结果，制定最合理的治疗方案，其中纤维肠镜检查是最全面且最直接的一种检查方法。

小儿慢性腹泻在检查时要以粪便常规检查为主，可确定是否有白细胞和红细胞，并检测是否有病毒或细菌感染情况。同时需要做纤维胃镜和纤维结肠镜检查，且可以在X线透视下动态观察整个消化道功能形态。另外，还要考虑接受十二指肠液检查以及右旋木糖排泄试验等。