自闭症是由遗传因素、神经递质因素、脑器质因素、免疫系统等引起的。
1、遗传因素：如果家庭中有人患有抑郁症，患者患自闭症的几率会增加，而自闭症患者的同胞患病率会远高于其他人。
2、神经递质因素：各种神经递质功能障碍与自闭症有关，如5-羟色胺神经递质和γ-氨基丁酸抑制系统异常可能导致自闭症。
3、脑器质性因素：自闭症患者多为第四脑室扩张、小脑蚯蚓发育不良、脑干明显萎缩，表明该病与中枢神经系统异常引起的功能障碍有关，自闭症儿童脑电图异常、神经系统体征异常、癫痫发作者较多。
4、免疫系统因素：如果患者在胎儿期有免疫缺陷，淋巴细胞对母亲抗体的反应会增加胎儿神经系统损伤的可能性，并可能出现自闭症。
