胃肠道疾病一般不会引起矮小症，引起孩子矮小症最主要的原因是生长激素的缺乏，当然如果孩子胃肠道功能长时间没有改善，也有可能造成孩子营养不良，长时间的营养不良也可以导致孩子生长发育的缓慢，出现矮小的症状。所以孩子胃肠道疾病最好到医院小儿内科或者消化内科进行治疗。