碳13呼气实验阳性，代表幽门螺旋杆菌感染，发现幽门螺旋杆菌阳性，排除用药禁忌后，一般建议正规而且足疗程的抗幽门螺杆菌治疗。
抗幽门螺杆菌的药物，通常使用质子泵抑制剂，其是一种抑酸药，如奥美拉唑、兰索拉唑、泮托拉唑、雷贝拉唑和艾斯奥美拉唑等，再加上两种特定的抗生素和铋剂口服，治疗的疗程大约是10-14天，建议到正规医院消化专科，来进行治疗。
幽门螺旋杆菌检查，主要以碳13和碳14呼气实验为主，如果是碳14检测，幽门螺杆菌正常值在0-100之间，如果是碳13检测，正常值在0-4之间，如果超出这两个范围，即说明感染幽门螺旋杆菌。