目前临床上认为巧克力囊肿的形成原因，是具有生长功能的子宫内膜异位到了卵巢位置，从而形成卵巢巧克力囊肿。它属于子宫内膜异位症的一种，病因主要是子宫内膜种植而形成的，所以巧克力囊肿的形成原因是因与饮食没有关系的。在正常情况下子宫内膜就在子宫腔内，随着卵巢分泌激素的影响而发生周期性的脱落，而子宫内膜跑到了卵巢的位置，就会形成卵巢巧克力囊肿，这种情况下如果囊肿较小是不用需要手术的。如果囊肿大于五厘米而且临床的不适的症状比较明显，则需要进行手术治疗。在饮食上应该避免食用辛辣、寒凉、生冷等刺激性的食物，这些食物不利于机体的恢复。

巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种，子宫内膜异位症的典型症状是下腹部疼痛。痛经疼痛是内异症的主要症状，它的典型症状为继发性痛经进行性的加重，疼痛一般多位于下腹部、腰骶部以及盆腔正中，有时可以呈现放射至会阴、肛门以及大腿，常于月经来潮时出现并且持续整个月经期，疼痛的严重程度与病灶大小不一定成比例，年龄严重的卵巢巧克力内膜异位症人患者，甚至可以引起无法忍受的疼痛，而且内异症的患者不孕正的比例是比较高的。它引起不孕症的原因比较复杂，比如盆腔微循环的改变影响精子、卵子相结合，性交不适也是比较常常出现的症状。

对于巧克力囊肿的女性，即使行腹腔镜手术将其切除，但由于在手术的过程中，并不是能够100%将异位的子宫内膜组织完全清除干净，所以在手术以后，仍然可能出现巧克力囊肿复发。对于巧克力囊肿复发的女性，如果这时囊肿比较小，痛经症状又不是特别严重那可以通过药物来保守治疗，比如口服达拉唑，或者是孕三烯酮。还可以考虑直接在月经期间，服用非甾体类的抗炎药，来进行对症止痛治疗。同时对于有生育要求的女性，一般在巧囊复发以后都不是特别大，所以可以考虑尽早备孕怀孕，因为在怀孕以后巧克力囊肿就会萎缩变小，甚至是可能自愈。但如果巧囊复发以后又超过5厘米，这时保守治疗效果不佳，就只能够考虑再次行腹腔镜手术将其切除，术后需要肌注曲普瑞林来避免巧囊的复发。

对于巧克力囊肿的患者饮食上不要过量的吃含有激素的东西以及含有大量雌激素的保健品。巧克力囊肿跟激素有一定的关系。在饮食时，要考虑所选择的食物有没有激素，比如豆浆对身体很好，但是吃很浓的豆浆也许就有影响了。如果吃胶原蛋白、蜂蜜或花粉类食物都不能量大，因为一旦量大，激素过量，对巧克力囊肿都是不利。另外，有一些不正规的保健品它会含有大量的雌激素，吃完以后可以感觉身体状态非常好，但实际上长期的大量的摄入，这些含有雌激素的保健品，有可能会促进或者导致卵巢巧克力囊肿的一个复发。而对于卵巢巧克力囊肿术后的病人的饮食并没有特别的禁忌，但是在手术后的一段时间病人要注意休息，适当的增加营养。

巧克力囊肿的诱发原因，一般就是子宫内膜异位症引起。另外，卵巢浆液性囊腺瘤或黏性囊腺瘤也可诱发。为什么会得巧克力囊肿，首先得知道巧克力囊肿实际是长在卵巢上的一个囊肿，但囊内液是那种巧克力的颜色。一般来讲，巧克力囊肿常常是因为卵巢的子宫内膜异位症造成，正常的子宫内膜异位到了卵巢的表面，每个月月经出血时也出血，时间长了以后就会形成咖啡色的咖啡色样的囊肿。这个囊肿会伴随月经的周期越来越大，甚至最后会发生破裂。除卵巢的子宫内膜异位症以外，还有卵巢的浆液性囊腺瘤或者是黏性囊腺瘤，也可能伴随囊内出血会出现咖啡色的液体。把液体抽出来时发现也是巧克力颜色。这个时候到底是什么样的囊肿，还需要把剥离出来在显微镜下观察，才能知道到底是什么原因造成，然后才能够去对症的去处理。总而言之，为什么会得巧克力囊肿，要知道是什么原因造成，更多的是卵巢的子宫内膜异位症或者是浆液性、黏性囊腺瘤的囊内出血。但为什么会得，这个原因目前还不清楚，还需要广大的医务工作者再进行深入探讨才能找到具体的原因。