牙龈萎缩是牙龈炎症的表现，主要治疗方法是治疗牙龈炎症。
如果是牙龈炎导致的牙龈萎缩，可以通过洗牙，将牙龈和牙周的牙石菌斑祛除干净，牙龈萎缩现象会得到缓解。洗牙是用超声波震荡方式祛除牙石周围的牙菌斑以及牙结石等刺激物，用双氧水和生理盐水对局部进行交替冲洗，在局部涂布碘甘油或派力奥软膏对牙龈消炎，用漱口水漱口。通常漱口有洗必泰溶液、康复新液和替消唑溶液等，用漱口水巩固洗牙疗效，维持口腔内的菌群环境，保持口腔卫生，使牙龈炎痊愈不再继续发展。牙龈会慢慢恢复到原来的位置。
如果是牙周炎造成的牙龈萎缩，不仅要洗牙还要做龈下刮治。早期牙周炎经过系统的基础治疗后，牙龈会恢复到正常位置。如果是重度牙周炎，有很深的牙周袋且有大量的牙槽骨吸收，牙根严重暴露，这类牙龈无法恢复。对牙周炎疾病要早期诊断早期治疗，早期就控制牙周疾病，不发展到晚期形成更严重的后果。同时牙龈萎缩，在进食后食物嵌塞要及时清除，合理使用牙线、牙缝刷及冲压器，对食物进行彻底清除。