脑血栓形成原因主要有血管壁的病变、血液成分的改变、凝血机制异、血流动力学的改变。脑血栓实际上就是缺血性脑血管病、脑梗死。
一、血管壁的病变，如动脉粥样硬化，大概70%的脑血管病患者都会出现动脉粥样硬化，是脑血栓的一个最主要的原因。另外还有动脉炎，如说风湿、结核或者钩端螺旋体的感染，梅毒的感染可能会激发脑血管的动脉炎。还有先天性的一个血管的病变，如说动脉瘤、脑血管的畸形。还有其的就是外伤、中毒、肿瘤导致血管的病变。
二，血液成分的改变。首先可以出现血液粘稠度的增高，如说高血脂、高血糖、高蛋白，或者患者出现脱水、红细胞增多，就是血液疾病，如白血病、血小板的增多，还有骨髓瘤，可能就会出现血液粘稠度增高。
三，凝血机制异。如说血小板减少性的紫癜，或者是血友病或者患者应用抗凝药，还有DIC就是弥漫性的血管内隐血，还有如说患者在妊娠的时候产后的时候，服用避孕药也容易造成高凝状态。
四，血流动力学的改变。最常见原因就是高血压，高血压是非栓塞性的血管病导致肺栓性血管病大概50至75%，高血压也是导致脑出血的一个最主要的原因。还有低血压功能障碍，如说心率衰竭、冠心病、房颤也可以导致脑血栓。还有其的少见的原因，也可以导致脑的缺血性改变。