扁平疣和脂肪粒区别主要有，疾病原因不同、传染性不同、症状不同以及治疗方法也不同。
扁平疣是由人类乳头瘤病毒HPV感染皮肤粘膜所引起一种良性赘生物，属于病毒类皮肤病。主要传染源是患者或健康带病毒者，主要通过直接或者间接接触传播，通过皮肤微小的破损进入上皮细胞，并进行复制增殖，导致上皮细胞异常分化和增殖，形成一种良性的赘生物。典型皮损为米粒至黄豆粒大小的扁平隆起性丘疹，圆形或椭圆形，表面光滑、质硬，正常肤色或淡褐色多，骤然出现数目较多，搔抓以后可形成串珠状排列，即自体接种反应或同形反应。病程是慢性的，多能自行消退，少数患者可以复发。
脂肪粒在皮肤科叫做粟丘疹，主要起源于表皮或者附属器上皮的一种储留性的囊肿，分为原发性和继发性两种。前者可以由新生儿开始由未发育的皮脂腺，或脆毛漏斗部下端的上皮所形成，损害可以自行消退。后者常发生在外伤、皮肤病或药物治疗后，皮损特点就是好发于颜面，特别是眼睑周围，继发者则发生于基础及病变的部位，典型皮损为黄白色，坚实性丘疹，表面光滑、顶端尖圆、无拢合，直径一般是1到2毫米，上覆极薄的表皮可挤压出坚实的角质样球状颗粒，一般无自觉症状。病程发展缓慢，可持续多年，偶可自行脱落消失，还可以用排针消毒以后挑破表皮，挤出黄白色的小颗粒，也可用激光或电烧方法进行治疗。