霉菌性阴道炎的治疗方式要根据具体病因选择，女性首选是局部用药。克霉唑片阴道上药，用药间隔是三天，今天晚上睡前上一片克霉唑片，三天后再上一枚，一个疗程两枚就能完全治愈。非白念菌首选口服伊曲康唑。伊曲康唑片200毫克每日两次，口服三天能杀掉所有非白念珠菌性阴道炎。治疗效果不满意可考虑做阴道分泌物培养并作药敏实验针对性治疗，针对白带做培养，哪种菌感染对哪种药敏感给予相应治疗。
霉菌性阴道炎是阴道里常驻菌霉菌的孢子出芽抽丝而发生的霉菌性阴道炎，最常见的是白色念珠菌。
所有霉菌都对克霉唑比较敏感，有些难治的霉菌性阴道炎不是白色念珠菌，对克霉唑效果不满意则考虑是非白念菌感染。有些人觉得是脚气导致了霉菌性阴道炎，脚气也是霉菌感染。菌株是光滑念珠菌和白色念珠菌。脚气不会引起霉菌性阴道炎，是两种念珠菌感染。非白念菌的治疗用克霉唑效果不好可考虑更换药物，用伊曲康唑片口服来治疗非白念珠菌性阴道炎。
注意霉菌的治疗和巩固治疗，复查两次阴性才可停止用药。一年犯霉菌4次以上叫复杂型或难治型霉菌性阴道炎，需巩固治疗半年时间。