胃肠疾病有很多，比如急性胃炎，慢性胃炎，胃溃疡，十二指肠溃疡溃疡，各种原因引起的肠炎，肠穿孔，癌症等等。如果是上消化道疾病，表现出胃痛，反酸。食欲不振，呕血等情况应该检查胃镜，x线钡餐。腹部彩超等。如果是下消化道胃肠疾病，表现出腹泻，腹痛，水样便，脓血便等。应该检查肠镜，直肠指诊，便常规等。
根据不同的疾病采取不同的治疗。随超声技术持续发展，在造影剂的作用下使胃腔充盈，超声检查能清晰显示胃壁结构、有无溃疡、病变性质、侵犯程度等。对于直肠、结肠等病变，超声检查可通过腔内探头清晰显示直肠结构，判断有无炎性病变、肿瘤，或肿瘤的部位、侵犯程度等；超声还具有穿透力，可观测到黏膜下病变，辅助临床医生判断、评估病情，对下一步治疗给予指导性意见。超声是对胃镜检查的有利补充，但不能代替胃镜。