甲流病毒进入人体的呼吸道以后，进入呼吸道的细胞，然后病毒复制，破坏细胞，然后病毒再次进入新的细胞，这是一个病毒复制、传染的过程。过程之中时间有长有短，在这个阶段，一般来说只有到潜伏期末。为什么是潜伏期末，因为随着病毒的复制，不断的大量的病毒产生，不断的感染更多的细胞。当更多的呼吸道细胞逐渐出现细胞的炎症、坏死，然后病毒再次大量的复制过程，如此反复的循环，终于到一个人体能够耐受的极限之后，甲流的症状就会表现出来，人就会出现急性发热、呼吸道症状、全身中毒症状就都出现。
所以一般来讲，在潜伏期末，患者感染甲流以后，患者会有传染性，因为病毒复制量已经比较大。所以一般来说，认为在潜伏期末，患者会出现传染性。