孕妇在早孕期间有褐色分泌物有两种原因。第一种可能是由于子宫内膜脱落导致的褐色分泌物现象。第二种可能是由于孕妇本身患有炎症，炎症刺激导致的褐色分泌物现象。所以在早孕期间有褐色分泌物，需要孕妇及时就医治疗，防止影响胎儿的健康。另外，孕妇也要注意自己的卫生，经常清洗阴道，勤换内裤。