流产流不干净的原因是比较多的，比较常见的是子宫内膜受到了损伤所引发的，或者是短时间内人流次数过多造成的。比如在流产过后出现了流不干净的现象，通常会引起腹部疼痛以及阴道出血量较多现象，一般需要去医院再一次做清宫术进行治疗，将宫腔内残留的胚胎刮出。