怀孕50天做B超检查是可以看到孕囊的，在怀孕正常情况下30天到40天左右时间能够形成孕囊，在怀孕50天左右可以通过B超检查来判断孕囊和胎芽。在怀孕50天时候如果没有孕囊有可能是因为胚胎发育不良引起的，最好观察一个星期后再到医院进行检查，如果还是没有孕囊，要及时在医生的指导下，通过口服流产药物或者是手术等方式来终止妊娠，能够使身体快速恢复正常。