卵巢囊肿不一定是需要手术的，因为卵巢囊肿分为生理性的和病理性的囊肿。生理性的囊肿是由于功能性的原因，比如说妇科内分泌失调所引起的囊肿这时候一般是不需要进行手术的。而一些病理性的囊肿，比如说卵巢畸胎瘤、子宫内膜异位囊肿是需要进行手术治疗的，而且囊肿大于五厘米则必须进行手术，因为有一部分囊肿有癌变的可能性，需要从肿瘤生长的速度以及其他的相关化验指标来决定。如果肿瘤的生长速度过快而且肿瘤标记物比较高，有恶变的可能性或者是超声检查发现肿瘤血流改变，呈腺囊实性的肿瘤甚至实性的都需要进行手术治疗以排除恶变、恶性肿瘤的可能。

对于大多数的卵巢囊肿来说，尤其是卵巢的生理性囊肿，不需要进行治疗。对于子宫内膜异位症导致的巧克力囊肿，如果囊肿的直径小于五厘米，如果没有引起明显的临床症状，比如不孕症或是严重的痛经，或者由于囊肿的反复发生破裂，这种情况暂时可以先不进行治疗。而对于有生育要求的女性，可以鼓励她尽快的试孕。如果能够怀孕，往往在妊娠期和哺乳期的时间内没有月经来潮，巧克力囊肿可能会逐渐的吸收，囊肿也会逐渐的缩小。也可以采取一些保守治疗，像假孕疗法、假绝经疗法等等，可以在一定程度上抑制卵巢囊肿的生长，但是在停药之后是有可能会发生复发。如果是由于囊肿反复的破裂，或者由于巧克力囊肿引起的不孕症，或者由于囊肿大于五厘米以上，囊肿不能判定为良性还是恶性，就需要进行手术治疗。子宫内膜异位囊肿在手术之后也有复发的可能性，对于没有进行手术治疗的女性，可以采取药物治疗或者是局部的穿刺治疗，但是所有的治疗方法都有一定的复发率。对于卵巢的炎性囊肿，通过规范的抗生素治疗之后，炎性囊肿会逐渐的缩小，症状逐渐的缓解消失。但是由于慢性盆腔炎所导致的卵巢炎性囊肿也仍然有复发的可能。当机体抵抗力下降，可能会引起慢性炎症的急性发作。

卵巢囊肿的药物治疗要根据卵巢囊肿的性质和种类来决定。使用的药物包括有非甾体类抗炎药、口服避孕药、孕激素、孕激素受体拮抗剂、孕三烯酮、达那唑、促性腺激素释放激素类似激动剂等等。1、一般来说，对于卵巢的生理性囊肿是不需要进行药物治疗。在月经刚结束的时候进行超声复查，囊肿一般会自行消失。2、对于子宫内膜异位症导致巧克力囊肿，有很多种的药物都可以进行治疗。药物治疗目的是抑制卵巢功能，阻止内膜异位症的发展。主要适用于有慢性盆腔痛，经期痛经等等的症状，以及明显有生育要求的女性。3、对于较大的卵巢子宫内膜异位症的囊肿，特别是卵巢的包块性质未明者，是适合进行手术治疗。使用的药物包括有非甾体类抗炎药、口服避孕药、孕激素、孕激素受体拮抗剂、孕三烯酮、达那唑、促性腺激素释放激素类似激动剂等等。口服避孕药是最早用于治疗子宫内膜异位症的激素类药物，的目的是降低垂体的促性腺激素水平，并且直接作用于子宫内膜和异位内膜，导致子宫内膜萎缩和经量的减少。孕三烯酮，也就是假绝经疗法。目前常用的低剂量高效孕激素和炔雌醇的复合片，可以抑制子宫内膜的生长，缓解痛经和减少经量，可以连续应用或者是周期应用，连续应用的疗效是比较可靠的。这些药物都有一定副作用，停药后可能会出现囊肿的复发，要定期进行随访和观察。

卵巢是女性最重要的生殖内分泌器官。位于盆腔，在子宫的左右各有一个。卵巢囊肿顾名思义就是在卵巢上出现了一个囊性的包块。卵巢囊肿可以分为生理性的和病理性的。生理性的囊肿常常是因为排卵以后的一个卵泡或者是一个黄体，或者是卵巢排卵以后的一个血体，出现一个短时间内的一个囊性的小包块，这属于生理性的，但是常常可以逐渐的自行吸收或者消失。病性的囊肿原因非常复杂，到目前来讲，还没有找到是什么原因导致的卵巢的囊肿。当在做妇科检查的时候，发现卵巢有了囊中以后，临床的医生要根据种种的迹象，然后进行综合的分析，判断它是生理性的，还是病理性的，还是良性的，还是恶性的。有些囊肿，生理性的囊肿可能会不治自愈，就会逐渐的消失。但是有些囊肿如果是病理性的，会逐渐存在，会一直存在，甚至会逐渐长大。目前还没有一个确切的认识，确切的诊断，有可能是一个病理性的囊肿，但是也有可能是一个卵巢的子宫内膜异位样的囊肿。但不管是什么囊肿，原因现在还不清楚，还需要科学不断的在进步，在进行去探索，进行一些确诊。

手术的方式分为腹腔镜手术及开腹手术，具体的手术方式要根据病情来决定。卵巢肿瘤的组织成分是非常复杂的，是全身各个脏器原发性肿瘤类型最多的器官，不同类型的组织学结构以及生物学的行为都存在很大的差异性。卵巢肿瘤的主要的组织学类型包括上皮性肿瘤、生殖细胞肿瘤、性索间质肿瘤以及转移性肿瘤。良性肿瘤，还有可能会由于发生卵巢囊肿的蒂扭转、卵巢囊肿的破裂或卵巢囊肿继发的感染，需急诊手术治疗。良性的卵巢囊肿恶变会使手术的范围增加，损伤增大。在妇科检查时，如果发现有卵巢囊肿要做进一步的随访和观察，如果考虑卵巢囊肿为良性，要根据肿瘤的大小、肿瘤的性质、患者的年龄、患者有无生育的要求来决定手术的范围，如果考虑有卵巢囊肿蒂扭转、卵巢囊肿的破裂或卵巢囊肿有恶变的可能性，要及时的进行手术治疗。