如果卵巢巧克力囊肿已经破裂，建议应该立即进行手术，将破裂的囊肿切除，并且在术中尽量清洗盆腔，主要的目的是将盆腔内的破碎的囊液全部清洗干净，避免具有活性的子宫内膜移位的细胞，种植在其他的脏器上，以免引起盆腔的内膜异位症。建议患者在术后应该给予达菲林治疗半年，避免囊肿的复发。另外也可以在宫腔内放置曼月乐环，主要的目的使子宫内膜萎缩，从而达到治疗子宫内膜异位症的目的，避免卵巢巧克力囊肿复发那么，此类患者在术后一定要进行定期的复查，每半年做一次超声检查。

目前临床上认为卵巢巧克力囊肿是有可能发生遗传的，因为巧克力囊肿属于卵巢型子宫内膜移位症。虽然具体确切的致病原因尚不明确，但是因为研究表明，卵巢巧克力囊肿具有一定的家族聚集性。因此我们认为巧克力囊肿中有一定的遗传的可能。如果女性患者家族中的母亲或者姐妹有发生巧克力囊肿的病例，患有巧克力囊肿的可能性就会明显的高于没有家族史的女性，所以建议此类人群在日常生活中应该避免紧张焦虑的情绪，避免压力过大。在日常生活中避免食用辛辣、寒凉刺激性的食物。

对于卵巢巧克力囊肿，是不建议在月经期间来进行检查的。因为有一部分囊肿是生理期产生的，比如说黄体囊肿，储留囊肿等等。一般在月经干净后两到三天来进行超声检查，经期检查过后可以再过一段时间再进行复查以防误诊。一般首次做b超查出囊肿后，医生都会建议观察一段时间再进行复查，而且对于巧克力囊肿可以进行双合诊或者三合诊的妇科检查。但是三合诊双合诊是不建议在来月经期间进行检查的，所以在月经干净后可以进行女性的妇科内诊检查。而抽血进行血CA125的检查，也是检查巧克力囊肿的一个指标。而有一部分患者在来月经时检查CA125会出现轻度升高，而月经干净后CA125就会降低。

卵巢巧克力囊肿可以表现为渐进性痛经，腹腔内粘连，无菌性炎症，不孕，恶变等症状。一、会出现一个渐进性的痛经，渐进性的痛经就是说以前可能每次来月经的时候不疼，现在就开始疼，而且随着时间的延长一次次月经的到来，痛经会越来越严重，这就是卵巢巧克力囊肿的一个痛经的表现，叫渐进性痛经。二、会导致一些腹腔内的粘连，腹腔内的粘连有什么症状，可能平时就会有一些胀气，肚子胀气或者排便受影响这些表现，总是会觉得腹胀。三、常会引起一些腹腔内的这种无菌性的炎症，比如说有这种无菌性的盆腔炎，有的人就会有一些下坠的感觉或者有一些肚子疼的感觉。四、卵巢巧克力囊肿的特征性的症状就是不怀孕，尤其是年轻的育龄女性，因为卵巢的巧克力囊肿它容易在肚子里破裂，破裂之后会有一些囊液流出造成输卵管的粘连，游走性的失调，甚至输卵管不通畅导致不怀孕。五、极少数的卵巢的巧克力囊肿有可能恶变为卵巢的上皮性癌，比如说透明细胞癌、比如说子宫内膜样癌，这也是它的一个表现，但极其罕见，卵巢巧克力囊肿恶变的几率是非常低的。

卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病变，卵巢巧克力囊肿病变可只累及一侧卵巢，但约有50%以上的患者会累及双侧卵巢；随着病情的发展，患者可出现痛经、持续性下腹疼痛、月经失调、不孕和性交痛等病症。目前主要有西药治疗、手术治疗和中医治疗技术等，药物治疗主要目的是抑制雌激素合成，使异位种植的子宫内膜萎缩，或切断下丘脑-垂体-卵巢轴的刺激和出血周期，但对于较大的巧克力囊肿，不宜采用性激素治疗，腹腔镜是目前手术治疗内异症的主要手段。