内分泌失调要针对不同病因，选择不同的药物，对激素分泌过多造成的功能亢进以抑制、消减为原则，用药物抑制激素的分泌和合成。对激素分泌过少造成的失调，原则上是补充其不足，包括补充生理剂量的激素，如甲亢用抑制甲状腺激素合成的药物，如甲巯咪唑或丙硫氧嘧啶，甲减补充甲状腺激素，泌乳素增高可以用溴隐亭抑制泌乳素生成等。
内分泌失调要根据症状找其原因，比如是靶器官如卵巢、甲状腺、肾上腺等导致的内分泌失调，还是垂体、下丘脑引起的，根据症状和体征，可以做相应的检查明确。