卵巢巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种是非常容易复发的，目前临床上治疗子宫内膜移位症的根本目的是缩减和去除病灶、减轻和控制疼痛、治疗和促进生育、预防和减少复发，那么她的治疗方法应该根据患者的年龄症状、病变部位、病变范围以及对生育的要求加以选则。目前临床上强调个体化的治疗，可以选择药物进行治疗，治疗的目的是抑制卵巢功能阻止内膜异位症的复发，这种治疗方式适用于有慢性盆腔痛、经期痛、疼痛症状比较明显，而且有生育要求，没有卵巢囊肿形成的患者对于较大的卵巢、子宫内膜异位囊肿，特别是卵巢内的囊肿的性质没有明确者，并应该采取手术治疗。

巧克力囊肿是具有生长功能的子宫内膜、腺体或间质移位到了卵巢上会发生卵巢巧克力囊肿。随着月经这种囊肿会逐渐的增大，并且发生盆腔组织粘连，引起腹痛。患者会出现进行性加重的痛经，由于巧克力囊肿是受到体内性激素水平影响的，所以在来月经期时会发生疼痛，我们可以按照治疗痛经的方法来缓解疼痛，可以使用一些孕激素或者是一些抑制前列腺素合成酶的药物，比如布洛芬或者是双氯芬酸钠等等。另外也可以通过肌注六个月的醋酸亮丙瑞林来抑制子宫内膜异位症以及巧克力囊肿的生长，从而缓解腹部疼痛。

女性患有巧克力囊肿是可以通过做阴式超声检查出来的，超声时会显示卵巢上面有囊肿或者盆腔里面有囊肿，这种囊肿和其他生理性卵巢囊肿是不一样的。它是具有血液循环有血供的，而且这种情况在结合患者平时的临床症状就可以做出准确的。有巧克力囊肿的患者，一般在临床上会出现痛经，或者月经前后有过月经期同房使，做人工流产清宫手术，这一类的宫腔操作史都会继发性的引起痛经，这种情况考虑有巧克力囊肿的可能。必要时可以通过做核磁共振来明确诊断，或者通过抽血检查，如果发现肿瘤标记物ca125升高，这时考虑巧克力囊肿的可能。

做完卵巢巧克力囊肿手术后的注意事项有两点，第一点是配合医生皮下注射GnRH-a制剂，第二点是如果有生育要求，应尽早怀孕。第一点，做完卵巢巧克力囊肿手术后，要皮下注射GnRH-a制剂，比如亮丙瑞林，能暂时抑制子宫内膜，导致月经不来，从而达到预防复发的目的。第二点，如果有生育要求，尽量在半年之内怀孕，如果半年之内没有怀孕，复发率会升高。必要时可以做试管婴儿尽快的怀孕。

巧克力囊肿会影响月经吗？一般来讲，卵巢的巧克力囊肿不会影响月经，因为月经是由卵巢的雌孕激素，是由整个人体内的有一个生殖内分泌轴来决定月经的。卵巢它主要是分泌雌孕激素，雌孕激素作用在子宫内膜，使子宫内膜出现周期性的变化，出现周期性的脱落，那么在脱落的过程中会有出血，所以我们叫它月经。一般来讲卵巢的巧克力囊肿不会影响卵巢分泌雌孕激素，所以它对月经的影响几乎没有。如果说患者的月经不正常，到医院来检查，可能会是因为其他的原因造成的月经的不调，而并非是因为卵巢的巧克力囊肿。当卵巢巧克力囊肿长得过大，或者出现破裂的时候，在这种情况下，有可能使患者暂时的出现月经的不正常。比如说点滴出血，或者是时间过长，也可能会出现闭经。但总的来讲，卵巢的巧克力囊肿不会影响正常的月经。