前列腺结石常与前列腺增生、前列腺炎、尿道狭窄同时存在。临床上，前列腺结石有尿频、尿急、血尿、排尿困难等症状，如感染。同时，还可能出现排尿滴沥、尿潴留、灼热样尿痛或腰部、会阴、阴道放射性疼痛、性欲低下、射精时疼痛、血精和阴茎勃起异常。
有些小前列腺结石自行排入尿流，排出前后、病人多呈现会阴、阴道和下背钝痛。结石的存在迟早将加重腺体感染，症状逐渐加重。因结石酿成脓肿时，若任其发展，可能破入尿道、直肠或会阴，甚至耻骨上形成痿道，病人可出现严重会阴、直肠和下背疼痛，体温上升，直肠前列腺检查局部有明显压痛。
